обогатяването проучвания изискват изчисляването на данните за секвениране за да се определи нивото на покритие. Това се прави предимно с ген секвениране лаборатории , които изискват интегриран подготовка ДНК проба и предварително обогатяване обединяване . Изчисляване секвениране покритие изисква използване на променливи, които включват секвениране покритие средната , общите насочена бази и ефективността на обогатяване . Извършване на това изчисление се извършва чрез въвеждане на всички тези променливи в уравнението . Инструкции

1

Напишете уравнението използва за изчисляване на средната покритие секвениране. Това ще прилича на желания обхват , разделено на средната нормализирана покритие. Ако желаното покритие е 10x , а средната нормализирана покритие е 0.2 , тогава средната покритие секвениране е 50.

2

Напишете уравнението , използвана за изчисляване на размера на секвениране. Това ще изглежда като (общо целеви бази ) (средно секвениране покритие ) /( ефективност обогатяване) = размер на секвениране.

3

Plug в 62 MB за “ общите целеви бази “ и 0.65 за на “ обогатяване ефективност. “ Добави размера на секвениране покритие на 50x и уравнението ще изглежда като (62) (50) /0.65 . Резултатът от уравнението ще бъде 4,8 GB на данни за секвениране .