Как да се изчисли на Каталитичен ефективност

Ензимите са важни молекули – те катализират реакциите , които правят живота да се случи. Природата има забележителен разнообразие от ензими, които катализират голямо разнообразие от реакции . При сравняване на тези ензими , понякога може да бъде полезно да се разглеждат от гледна точка на тяхната каталитична ефективност , също наречен константата на специфичност , който измерва колко ефективно ензим превръща субстрата ( молекулата действа на ) в продукта . За ензими, които следват какво биохимици наричат ​​Michaelis – Menten кинетика , тази константа може лесно да бъде изчислена от експериментални данни . Инструкции

1

Напишете км и Kcat . Тези константи се определят експериментално , така че би трябвало вече да го има , преди да започне да се опитва да се изчисли константата на специфичност .

2

Спомнете си, че километра представлява ( к -1 + k2 ) /k1 , където k1 е скоростната константа за образуването на ензим – субстрат комплекс , К – 1 е константа за разпадането на този комплекс процент , и k2 е константа за образуване на продукт от комплекса ензим – субстрат процент. Друг ( и може би по- светещата ) начин да се определи Km е концентрацията на субстрата , когато реакцията се работи при половината от максималната скорост . Ако ензим има голям Km , това отнема много на субстрата да достигне максимална скорост на ензима , а малка Km означава само, че е необходимо малко субстрат за насищане на разположение ензима.

3

Спомнете си, че Kcat е константа за етапа , ограничаващ скоростта на реакцията на ензим – катализирана процент . Стъпка , ограничаващ скоростта е най-бавния етап или пречка , която определя колко бързо цялостната реакцията може да се изпълнява.

4

Divide Kcat от Km да получите константа специфичност . Например, ако Kcat е 600 секунда ^ -1 и Km е 10 микромола , тогава каталитичен ефективността е 60 микроМ ^ -1 S ^ -1.

5

Имайте предвид, че скоростта на дифузия задава горната граница на максималната каталитична ефективност , обикновено от порядъка на 10 ^ 8 до 10 ^ 9 м ^ -1 S ^ -1 . Биохимиците понякога ще кажат, че ензим, чиято каталитична ефективност подходи този лимит е постигнала „каталитичен съвършенство “ .

Вашият коментар